SAT(核酸恒温扩增实时荧光检测技术)是一种新型RNA检测技术。
该技术为我国自主创新的RNA检测技术,是目前CFDA批准的核酸恒温放大实时荧光检测技术产品,拥有两项核心发明专利技术
一、特异性靶标捕获技术(特异磁珠法,中国专利号:200810111478.6):
磁珠微粒表面标记oligo(dT),在该段oligo(dT)上连接带有一段oligo(dA)的特异性的核酸捕获片段。
当捕获探针与靶标核酸结合后,用磁铁吸附磁珠,即可将靶标核酸特异性的提取出来。
技术特点:较大限度去除杂质,获得高纯度产物
二、RNA实时荧光恒温扩增检测技术 (Simultaneous Amplification and Testing, 中国专利号:200810111479.0)
靶标RNA在RT酶作用下逆转录合成一条带T7启动子的双链DNA,T7 RNA聚合酶以这条双链DNA为模板进行转录,每个cDNA分子可以转录出100~1000个拷贝的RNA,合成出的RNA与分子信标结合,发出荧光,可以被荧光检测仪检测到。与此同时,新合成的RNA继续在RT酶和T7 RNA聚合酶的作用下循环逆转录和转录的过程。如此往复,以达到高效扩增的目的。
三、目前病原体检测常用的实验室检测方法及特点
检测方法
检测样本
特 点
细菌培养
痰液 / 拭子
慢培时间过长,对临床要求的快速准确检测结果意义相对较小;快培杂菌过多特异性过低,准确率低,易漏检误检;
免疫法
血清
取样和操作简单,但存在较长的“窗口期” ,导致假阳性率过高;无法区分既往感染,导致假阳性问题
PCR
痰液 / 咽拭子
高灵敏度和高特异性,不能区分“死菌”“活菌”,病原体持续存在导致假阳性问题
SAT
痰液 / 咽拭子
高灵敏度和高特异性,缩短窗口期;可区分“死菌”“活菌”,避免假阳性
表1 临床常用检测方法
|
SAT |
PCR |
RT-PCR |
SAT对应优势 |
起始模板 |
RNA |
DNA |
RNA |
相较于DNA,RNA在病原体内数量为1000~1000条,起始模板多,灵敏度高 |
扩增原理 |
逆转录-转录 |
复制 |
逆转录→复制 |
不同的扩增原理,SAT在灵敏度、特异性、扩增时间等上更有优势 |
特异性 |
非常高 |
高 |
高 |
磁珠提取法,特异性探针靶标捕获最大程度上去除反应抑制剂,提高反应特异性; |
区分死菌 / 活菌 |
能 |
不能 |
能 |
DNA不容易降解,RNA容易降解。菌体死亡后前者短期内不可判愈,后者可以。前者有假阳性 |
※SAT与PCR检测技术的方法学优势
1. 病原体死亡后RNA可以很快降解,避免因菌体死亡后DNA持续存在导致的假阳性;检测靶标为RNA,扩增起始模板数量高,所以灵敏度更高,避免假阴性;
2. 磁珠法进行核酸提取,特异性磁珠捕获可以最大限度去除杂质,抑制物少,提高特异性。
3. 用分子信标进行检测,提高特异性。
4. 扩增产物为RNA,产物易降解,减少实验室污染风险,进一步降低假阳性风险。
5. 42℃恒温扩增,降低实验室设备要求,仪器损耗小,且可以缩短检测时间。