分子诊断近年来发展迅速，应用于遗传性疾病的诊断、感染性病原体检测、肿瘤易感基因检测与分子分型、伴随诊断和预后评估等领域，在疾病的诊断和治疗中发挥越来越重要的作用。

传染病病原体的准确检测是传染病有效防控的前提，也是合理用药的基础。然而，传统的病原体分离、培养等诊断方法不能完全满足临床治疗和疾病控制的需要。新发展的传染病分子诊断技术可有效弥补传统方法的不足。

分子诊断即利用标本中的核酸(DNA或RNA)为检测对象，针对感染性疾病、肿瘤、遗传性疾病等进行诊断和预后判断的作法。相较于DNA检测，RNA检测在病原体感染临床诊断上具有下列优势：

1. 靶标为RNA，扩增起始模板数量高，检测灵敏度高
➣以检测靶标为核糖体RNA（rRNA）为例说明，rRNA在细胞中的含量较DNA高，一个细胞约有高达10⁴~10⁵个拷贝，初始检测模板量大，可以有效提高检测灵敏度。

2. 病原体死亡后，RNA降解速度快，检测结果可有效区分是否为一过性感染((死菌或活菌)，有助于临床判愈及治疗方案选择，避免无效治疗。